Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb1A2AQ07 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms