Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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