Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms