Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms