Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0U1RNP2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0U1RNP2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms