Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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