Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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