Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1J5

Ighv9-3, Immunoglobulin heavy variable V9-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms