Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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