Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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