Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trbv31A0A075B5J5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trbv31A0A075B5J5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trbv31A0A075B5J5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trbv31A0A075B5J5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trbv31A0A075B5J5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Trbv31A0A075B5J5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trbv31A0A075B5J5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Trbv31A0A075B5J5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trbv31A0A075B5J5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Trbv31A0A075B5J5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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