Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
UHRF2Q96PU4 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms