Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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