Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C17orf47Q8NEP4 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms