Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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ZNF548Q8NEK5 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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ZNF548Q8NEK5 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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ZNF548Q8NEK5 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ZNF548Q8NEK5 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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