| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL139132.1-201 | ENST00000431587 | 344 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL135938.1-201 | ENST00000443141 | 297 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL731568.1-201 | ENST00000445111 | 434 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | EEF1E1P1-201 | ENST00000446998 | 430 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Z73417.1-201 | ENST00000447373 | 778 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | EEF1B2P7-201 | ENST00000451177 | 676 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC092264.1-201 | ENST00000456002 | 713 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL606519.1-201 | ENST00000458146 | 580 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPS29P20-201 | ENST00000489592 | 171 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPS15AP36-201 | ENST00000492022 | 382 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC104685.1-201 | ENST00000502445 | 371 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | UBA6-AS1-204 | ENST00000502758 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC099520.1-202 | ENST00000503650 | 777 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC104090.1-201 | ENST00000506341 | 1171 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-237P-201 | ENST00000515985 | 71 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RN7SKP272-201 | ENST00000516988 | 232 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC010196.1-201 | ENST00000550014 | 450 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTND1P24-201 | ENST00000552175 | 861 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LINC02274-201 | ENST00000555539 | 1174 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC012404.2-201 | ENST00000558572 | 481 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MSMB-202 | ENST00000582163 | 488 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC100778.1-201 | ENST00000583579 | 332 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC234772.3-201 | ENST00000602277 | 528 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL596327.1-201 | ENST00000603629 | 213 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | PRELID3BP8-201 | ENST00000604148 | 295 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC068057.2-201 | ENST00000624047 | 895 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC244517.7-201 | ENST00000625144 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC103706.2-201 | ENST00000638080 | 240 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | BAZ2B-202 | ENST00000343439 | 2364 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | PIK3C2G-201 | ENST00000266497 | 4764 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | EYS-202 | ENST00000342421 | 2168 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-157P-201 | ENST00000383957 | 107 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPS4XP8-201 | ENST00000402039 | 771 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPL17P12-201 | ENST00000413391 | 526 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | BMS1P22-201 | ENST00000414726 | 313 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | HIGD1AP15-201 | ENST00000416198 | 280 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC073641.1-201 | ENST00000425192 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL445488.1-202 | ENST00000430623 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | USP12PX-201 | ENST00000432383 | 1057 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNRPEP9-201 | ENST00000436794 | 238 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC093156.1-201 | ENST00000440382 | 670 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | COX6CP12-201 | ENST00000446748 | 202 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL513124.1-201 | ENST00000450410 | 614 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC011998.3-201 | ENST00000457053 | 254 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | APOA2-205 | ENST00000468465 | 421 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AHI1-208 | ENST00000488690 | 712 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC090096.1-201 | ENST00000489168 | 390 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC034222.1-201 | ENST00000494052 | 532 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC105389.2-201 | ENST00000506475 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-927P-201 | ENST00000516199 | 100 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NARSP2-202 | ENST00000522022 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CARD18-202 | ENST00000530950 | 652 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | FAM96A-206 | ENST00000559950 | 561 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NR2F2-AS1-208 | ENST00000560395 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC012146.1-204 | ENST00000570712 | 426 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TCF4-AS2-201 | ENST00000586467 | 445 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-88P-201 | ENST00000606801 | 100 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL136981.2-201 | ENST00000617319 | 734 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNHG22-203 | ENST00000617833 | 660 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL591441.2-201 | ENST00000620059 | 535 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC023510.2-201 | ENST00000622162 | 746 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC009039.2-201 | ENST00000624524 | 529 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ZNF117-204 | ENST00000620222 | 5317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NEDD4-208 | ENST00000508342 | 7235 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC110491.1-201 | ENST00000562191 | 2010 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ZNF680-202 | ENST00000447137 | 2159 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CCDC66-201 | ENST00000326595 | 3027 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KIAA1107-202 | ENST00000636278 | 4065 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNA5SP393-201 | ENST00000363423 | 117 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-1083P-201 | ENST00000384022 | 107 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORD15B-201 | ENST00000384714 | 146 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC010731.3-201 | ENST00000415029 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ELF3-AS1-201 | ENST00000415582 | 500 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SPATA17-AS1-201 | ENST00000415765 | 420 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTCO2P21-201 | ENST00000419780 | 677 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | BPY2DP-201 | ENST00000422208 | 265 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NUP35P1-201 | ENST00000422734 | 947 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NAALADL2-AS2-201 | ENST00000424690 | 1038 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MED14P1-201 | ENST00000430517 | 648 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL080284.1-201 | ENST00000434493 | 442 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC105272.1-201 | ENST00000438604 | 198 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | GSAP-208 | ENST00000441833 | 737 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL591719.1-201 | ENST00000444669 | 744 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TPT1P14-201 | ENST00000448018 | 505 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CSN1S1-202 | ENST00000505782 | 871 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTND5P13-201 | ENST00000513046 | 1079 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC114781.4-201 | ENST00000513707 | 639 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC110296.1-201 | ENST00000515680 | 341 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RN7SKP265-201 | ENST00000516448 | 223 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC105185.1-201 | ENST00000518705 | 535 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC087276.4-201 | ENST00000530042 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC023442.3-201 | ENST00000532199 | 495 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC023538.1-201 | ENST00000534576 | 736 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MYL12A-202 | ENST00000536605 | 899 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC023050.2-201 | ENST00000544968 | 387 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NACAP3-201 | ENST00000552100 | 481 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MRPL42-208 | ENST00000552217 | 920 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC023824.2-201 | ENST00000566185 | 400 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL354943.1-201 | ENST00000572103 | 781 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MYL12A-209 | ENST00000580887 | 899 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |