Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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