Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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