Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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COL19A1Q14993 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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