Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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DDX39BQ13838 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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