Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TOP3AQ13472 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TOP3AQ13472 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms