Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPA4Q13156 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.3 ms