Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CNTN1Q12860 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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