Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXD10P28358 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXD10P28358 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXD10P28358 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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