Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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