Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRQQ9UMZ3 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRQQ9UMZ3 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRQQ9UMZ3 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRQQ9UMZ3 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRQQ9UMZ3 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRQQ9UMZ3 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRQQ9UMZ3 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRQQ9UMZ3 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
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