Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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