Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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