Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms