Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SGCAQ16586 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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