Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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