Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms