Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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