Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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