Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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