Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL19A1Q14993 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms