Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms