Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms