Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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TCOF1Q13428 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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TCOF1Q13428 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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TCOF1Q13428 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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TCOF1Q13428 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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TCOF1Q13428 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TCOF1Q13428 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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TCOF1Q13428 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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