Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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