Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CRXO43186 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CRXO43186 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CRXO43186 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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