Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-1B6SEH8 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms