Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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