Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms