Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms