Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
IMPG1Q17R60 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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