Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms