Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms