Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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