| RUNX2 | Q13950 | CNOT6L-201 | ENST00000504123 | 8843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WDR49-201 | ENST00000308378 | 2594 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SULT1B1-201 | ENST00000310613 | 7115 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC39A10-202 | ENST00000409086 | 5432 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC30-203 | ENST00000428554 | 3063 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC30A6-203 | ENST00000379343 | 2354 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ERMN-205 | ENST00000410096 | 3793 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF439-201 | ENST00000304030 | 2622 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIAA1107-203 | ENST00000637221 | 4337 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP295-201 | ENST00000362655 | 121 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-283P-201 | ENST00000364788 | 107 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-701P-201 | ENST00000384059 | 107 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR493-201 | ENST00000385254 | 89 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-328P-201 | ENST00000390887 | 106 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068295.1-201 | ENST00000413056 | 153 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC003985.1-201 | ENST00000414127 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL158840.1-201 | ENST00000414132 | 523 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093865.1-201 | ENST00000415387 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF90P2-204 | ENST00000419323 | 1075 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136369.2-201 | ENST00000420825 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353771.1-201 | ENST00000422107 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355674.1-201 | ENST00000423681 | 648 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAC1P6-201 | ENST00000423911 | 575 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7L1P10-201 | ENST00000427790 | 463 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL078601.2-201 | ENST00000429444 | 474 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFB4P6-201 | ENST00000436819 | 366 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445490.2-201 | ENST00000440492 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SFTA1P-203 | ENST00000446372 | 693 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079781.2-201 | ENST00000446424 | 169 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026355.2-201 | ENST00000456755 | 723 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL31P60-201 | ENST00000478450 | 367 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL432P-201 | ENST00000484057 | 298 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC106707.2-201 | ENST00000484182 | 374 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P47-201 | ENST00000497299 | 556 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NREP-AS1-201 | ENST00000503242 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100773.1-201 | ENST00000505409 | 520 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP18-201 | ENST00000516005 | 275 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP258-201 | ENST00000517151 | 304 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00824-201 | ENST00000517583 | 805 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF706-202 | ENST00000517844 | 604 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003469.3-201 | ENST00000518090 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4LP26-201 | ENST00000518144 | 282 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104232.2-201 | ENST00000519680 | 769 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001804.3-201 | ENST00000525146 | 880 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001646.1-201 | ENST00000527936 | 915 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010185.1-201 | ENST00000542489 | 456 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008083.1-201 | ENST00000547748 | 663 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MEG8-215 | ENST00000555354 | 469 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445074.1-201 | ENST00000555362 | 318 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160191.1-201 | ENST00000555480 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121576.1-201 | ENST00000556055 | 276 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359212.1-201 | ENST00000556608 | 614 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC044840.1-201 | ENST00000577641 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3158-1-201 | ENST00000583596 | 81 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z84480.1-201 | ENST00000605131 | 311 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001330.5-201 | ENST00000607176 | 411 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016747.2-202 | ENST00000607743 | 332 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103710.3-201 | ENST00000608157 | 948 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL034408.1-202 | ENST00000636088 | 415 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009093.8-201 | ENST00000641769 | 292 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PANK1-202 | ENST00000322191 | 2513 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAD17-202 | ENST00000305138 | 3164 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCLO-206 | ENST00000437081 | 3786 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TPTE2-203 | ENST00000390680 | 1558 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BIRC3-201 | ENST00000263464 | 5197 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCLAF1-213 | ENST00000530767 | 4186 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.381-201 | ENST00000365666 | 102 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AIF1-202 | ENST00000376049 | 524 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR670-201 | ENST00000390142 | 98 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513331.1-201 | ENST00000411908 | 397 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BX842559.1-201 | ENST00000419615 | 532 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL451062.2-201 | ENST00000427515 | 271 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589986.2-201 | ENST00000429352 | 397 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01757-201 | ENST00000435552 | 480 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAAR7P-201 | ENST00000436141 | 242 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2V1P8-201 | ENST00000437166 | 265 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139383.1-203 | ENST00000445227 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z99127.3-201 | ENST00000448158 | 395 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034195.1-202 | ENST00000451031 | 610 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358075.2-201 | ENST00000452785 | 339 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084357.1-201 | ENST00000473404 | 255 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079382.1-201 | ENST00000493346 | 557 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026427.2-201 | ENST00000506228 | 536 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA67.7-201 | ENST00000516664 | 135 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1231P-201 | ENST00000517185 | 103 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV2-23-201 | ENST00000518729 | 323 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5B19P-201 | ENST00000531766 | 928 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003034.1-201 | ENST00000534621 | 422 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007368.1-201 | ENST00000536422 | 974 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NACA-211 | ENST00000548563 | 827 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF519P2-201 | ENST00000557032 | 169 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC044798.1-201 | ENST00000565146 | 418 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007363.1-201 | ENST00000604736 | 620 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009570.1-201 | ENST00000609599 | 745 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CERS6-AS1-209 | ENST00000609766 | 642 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX41-300 | ENST00000631048 | 69 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008505.1-205 | ENST00000637847 | 703 nt | TSL 5 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC49-224 | ENST00000560691 | 2531 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL137003.2-201 | ENST00000606924 | 2538 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD26P2-201 | ENST00000445530 | 1710 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |